O arquivo SWF é exibido acima de todas as camadas
Um arquivo SWF em uma camada em uma página DHTML que contém várias camadas é exibida sobre todas as camadas, independentemente da ordem de empilhamento das camadas ("z-index").
Solução: use o parâmetro WMODE
Use o parâmetro WMODE para permitir camadas de conteúdo de mídia rich com camadas DHTML. O parâmetro WMODE pode ser "janela" (padrão), "opaco" ou "transparente". O uso de um valor WMODE opaco ou transparente impede que um arquivo SWF file seja reproduzido na camada superior. E permite que você ajuste as camadas do filme dentro de outras camadas do documento HTML.
Para obter informações detalhadas sobre criação de arquivos SWF com planos de fundo transparente e mais informações sobre o parâmetro WMODE, consulte Criar um plano de fundo transparente em um arquivo SWF.
Observação: o parâmetro WMODE tem suporte somente em algumas combinações de versões de navegador/Flash Player. Se não houver suporte para o parâmetro WMODE, os arquivos SWF serão sempre exibidos no primeiro plano.
Informações adicionais
Por padrão, os navegadores colocam conteúdo de plug-in incorporado, como um arquivo SWF ou miniaplicativo Java, na camada superior. Em navegadores antigos, as tentativas de colocar uma camada DHTML sobre um Flash falham. Navegadores recentes adicionam a capacidade de dispor conteúdo de mídia rich com conteúdo DHTML. E, em alguns casos, adicionam a capacidade de usar planos de fundo transparentes no conteúdo de mídia rich.