您可以和處理其它 PDF 一樣處理從網頁建立的 PDF 文件。根據您在 Acrobat 中的配置，按一下轉換後的網頁中的連結可以在 PDF 末尾新增連結關聯的頁面 (如果這些頁面尚未納入此 PDF 文件)。

當您第一次從網頁建立 PDF 時，如果在「轉換設定」對話方塊中選取「建立書籤」，將生成標籤化書籤。表示 Web 伺服器的標準 (非標籤化) 書籤將顯示在「書籤」標籤的頂部。在該書籤的下面是各下載網頁的標籤化書籤；標籤化書籤的名稱來自於頁面的 HTML 標題或 URL (如果網頁沒有標題)。標籤化網頁書籤最初均位於同一層級，但是您可以重新排列它們，依照類別進行嵌套，以便保持網頁原來的層次結構。

如果您從網頁轉換 PDF 時選取「建立 PDF 標籤」，關於原始頁面 HTML 結構的結構資訊將儲存在 PDF 中。您可以使用此資訊來在檔案中新增段落和其它包含 HTML 元素的項目的標籤化書籤。